科摩罗首都莫罗尼赛义德•易卜拉欣王子国际机场（Aéroport international de Moroni Prince Said Ibrahim），距离市区23公里，往返机场主要搭乘出租车。
莫罗尼国际机场有肯尼亚、马达加斯加、坦桑尼亚、埃塞俄比亚、埃及及法国南方航空公司（Air Austral）班机经停，分别飞往内罗毕、达累斯萨拉姆、亚的斯亚贝巴、开罗和留尼汪。INT’AIR ILES和R’Komor航空公司有定期航班飞往昂儒昂岛、莫埃利岛，法国ewa航空公司每周有定期航班飞往马约特岛，均为小飞机。
科摩罗无中国直达航班。
联系电话：00269-773 15 95（莫罗尼国际机场）；00269-771 07 31（昂儒昂岛Ouani机场）；00269-772 03 71（莫埃利岛Bandar Es Salam机场；00262-269 64 54 00（马约特岛Dzaoudzi机场）。
科摩罗公路总长约900公里，其中483公里为柏油路。首都市政道路路况很差；环岛公路和县级公路年久失修，坑洼不平。无铁路。
中国驾照不能在当地直接使用，可凭该照在科交通局申请科摩罗驾照。科车辆右行，行人靠右。如自驾出行，须备足燃料和备用车胎。
科摩罗主要港口有莫罗尼港和穆察穆杜港，后者为科最大港口，可停靠2.5万吨级轮船。科三岛以及马约特岛之间定期有客船和货船往来。
联系方式：00269-773 97 04（莫罗尼港）；00269-771 01 43（穆察穆杜港）；00269-772 02 57（莫埃利港）；00262-269 60 10 33（藻德济港）。
无公共交通，可乘坐出租车出行。出租车为“拼车”式，市内收费标准约为300科郎/人。
科摩罗首都莫罗尼（Moroni）系科最大城市，人口约11万，面积约10平方公里，平均海拔30米。自1975年科摩罗独立以来，莫罗尼即为首都，是全国政治、经济、文化、教育和交通中心。科联盟政府各部委、金融机构等均坐落于市内。市内主要景点有星期五清真寺，国家博物馆等。莫罗尼市内有星级酒店两家：
—金色郁金香酒店（Hôtel Golden Tulip），电话：773 33 33
—莫罗尼酒店（Hôtel Retaj Moroni），电话：773 52 78
此外，科主要城市还包括昂儒昂岛首府穆察穆杜市（Mutsamudu）、莫埃利岛首府丰博尼市（Fomboni）、马约特岛首府马穆楚（Mamoudzou）市。
