在家畜中控制尼帕病毒
没有抗尼帕病毒的疫苗。用次氯酸钠或其它洗涤剂常规清洁养猪场并进行消毒预计可有效预防感染。
如果怀疑发生疫情，动物处所应立即隔离。扑杀遭感染动物，并密切监督掩埋或焚烧尸体可能是必要的，以减少向人类传播的风险。限制或禁止将受染农场的动物运到其它地区，可以减少疾病的传播。
由于家畜中的尼帕病毒暴发早于人类病例，所以建立动物卫生监测系统以发现新病例至关重要，可以为兽医和人类公共卫生当局提供预警。
减少人群的感染风险
在无疫苗情况下，减少人群感染的唯一途径是提高对风险因素的认识并教给人们可以采取哪些措施来减少与病毒的接触。
公共卫生教育信息应侧重于以下方面：
减少蝙蝠向人类传播的风险。预防传播的努力应首先注重减少蝙蝠与椰枣汁接触。还应将采集的新鲜椰枣汁煮沸，并应在食用水果前彻底清洗和去皮。减少人传人的风险。应避免与尼帕病毒感染者发生密切的身体接触。照护病人时应佩戴手套和防护设备。照顾或探访病人后应照例洗手。减少由动物传播给人的风险。在处理染病动物或其组织时，以及在屠宰和扑杀过程中应戴手套并穿防护服。
在卫生保健机构中控制感染
照护疑似或确诊尼帕病毒感染者，或处理从其身上采集的标本的卫生保健工作者应采取标准的感染控制防护措施。
从疑似感染尼帕病毒的人和动物身上采集的样本应由具有适当装备的实验室中训练有素的工作人员处理。
